Najvhodnejšou možnosťou prispôsobenia aplikačných modulov pre ich začlenenie do JIS HM, je prepracovať  systém interpretačno – prezentačných aplikácií  obdobne, ako je vypracovaný  systém aplikácií prístupu k dátovým zdrojom,  na systém postavený na client-server architektúre, ako súbor Web aplikácií založených na HTTP, prípadne na zabezpečenom HTTPS protokole.

Výhody plynúce z využitia tohto riešenia:
· Nezávislosť na konkrétnom Web serveri, Web klientovi, databázovom serveri a na operačnom systéme.
· Vysoká rýchlosť aplikácie daná Servlet technológiou a integráciou s rýchlym Web serverom.
· Moderná a perspektívna technológia postavená na „Server side Java“ – Java aplikácii použitej na strane servera, čo umožňuje užívateľom s jednoduchým prehliadačom používať aplikáciu.
· Centralizovaná údržba, aktualizácia a správa systému, keďže šablóny, dokumenty, aj databáza sa nachádzajú na jednom mieste.
· Vysoká flexibilita a modularita vytvorených aplikácií, bez nutnosti zasahovania do binárnych častí aplikácie.
· Jednotný transparentný mnohoužívateľský prístup v prostredí lokálnych aj rozľahlých sietí.